У 1985 році на СЮН були створені музей хліба і зал охорони природи. Музей хліба став своєрідним центром виховної роботи, пропаганди дбайливого відношення до хліба, поваги до найдавнішої і найпочеснішої праці хлібороба. Його створенню і подальшій пошуковій та виховній пізнавальній роботі сприяли постійні взаємозв’язки з Музеєм хліба Республіканської станції юних натуралістів (нині Національний еколого-натуралістичний центр, м. Київ).

Для того, щоб врятувати від загибелі людство, перебудувати свою свідомість, зрозуміти своє місце в цілому світі, гармонізувати відносини з природою, виникла негайна потреба істотно змінити принципи національної екологічної освіти, поглибити її зміст від народознавства до екологічного мислення. Починаючи з 1989 року педагогічний колектив СЮН почав працювати в напрямку створення екологічного музею.    

      В квітні 1991 року СЮН разом  з редакцією газети  «Дзержинець» провели перший Дитячий екологічний фестиваль «Попелюшка». Мета фестивалю – це привернення уваги громадськості до екологічного стану міста Дніпродзержинська та області. На фестивалі відбулась презентація кінофільму «Руку дружби, природо!» про добрі справи юних натуралістів    м. Дніпродзержинська.

      В 1992 році станцію юних натуралістів було перейменовано у Дитячий екологічний центр (ДЕЦ).

      Важливим етапом роботи центру починаючи з 1992 р. була співпраця з  Дніпровсько-Орільським природним заповідником. Вчені (зокрема             А.Г. Линдя, П.Т. Чегорка,  В.В. Манюк та інші.) постійно допомагали проводити комплексні екологічні екскурсії та експедиції на базі заповідника і природних комплексів Дніпропетровщини для вчителів і школярів міста.

Вченими заповідника разом із секретарем Українського товариства охорони птахів         Е.К. Харченко був проведений семінар-практикум для юннатів, присвячений Міжнародному дню спостереження за птахами. Вчені навчали юннатів як будувати штучні платформи для гніздування хижих птахів, які занесені в Червону Книгу України (зокрема орлан-білохвіст).

        В 1995 році був відкритий Міжшкільний екологічний музей (МЕМ), який на сьогоднішній день має звання «Народний музей» та «Зразковий музей».

Педколектив центру в своїй роботі спирається на просвітницькі можливості МЕМ, використовуючи методи музейної педагогіки. Музей і відеотека «Екологія – ХХ століття» програми «Tacis» (яка налічує понад 100 відеофільмів) склали чудовий симбіоз в удосконаленні пропаганди екологічних знань. З метою кращого використання просвітницьких можливостей МЕМ і відеотеки створені творчі об'єднання дітей: відеоклуби «Краплинка», «Райдуга», клуб «Джерельце».

        З 1998 року ДЕЦ очолила        А.І. Гаврилюк – справжній ентузіаст своєї справи, активіст юннатівського руху.  В тому ж році на базі ДЕЦ  відкрита філія слухачів еколого-натуралістичного факультету Дніпропетровського відділення МАН України. За ці роки дипломантами МАН стали 128 вихованців, 66 – призери обласного  та Всеукраїнського конкурсу-захисту науково-дослідницьких робіт. Серед них – 4 лауреати премії обласної програми «Обдаровані діти – надія України»: Болотов Віктор, Вовчанська Олена, Афендик Гліб, Шкальнюк Наталія. Старшокласники – гуртківці, члени МАН знаходять своє самовираження у спілкуванні з професійними науковцями вищих навчальних закладів – ДНУ, ДДМА, УДХТУ, ДДАУ та ДДТУ. Про широту інтересів юннатів свідчить тематика лише деяких експериментальних робіт: «Колоніальне поселення сірої чаплі в Радянському лісництві», «Флористичні дослідження як обґрунтування організації піщано-степового заказника», «Використання грунтових безхребетних як біоіндикаторів забруднення міського середовища важкими металами», «Вплив погодних умов на стан забруднення атмосферного повітря м. Дніпродзержинська», «Еколого-гідрохімічне дослідження Дніпродзержинського водосховища».

        5 червня 1999 року, вперше в Дніпродзержинську, у Всесвітній день охорони навколишнього природного середовища сталася надзвичайна подія – за ініціативою Дитячого екологічного центру, за підтримкою управління охорони навколишнього природного середовища міськвиконкому був проведений екологічний велотур «Стоп, СО₂!». В цей день діти запропонували як альтернативу автотранспорту – велосипед – екологічно чистий вид транспорту. У велотурі взяли участь 350 чоловік – юні натуралісти, школярі, студенти коледжів, технікумів та ДДТУ. Колона велосипедистів, одягнених в білі футболки з яскравим написом «Стоп, СО₂!» прямувала за маршрутом: лівий берег-новий міст – правий берег (довжина   15 км). Завершення маршруту відбулось в міському парку, де був проведений урочистий мітинг під девізом «Захист довкілля – наше майбутнє!». 

В 1999 році була створена неурядова дитяча екологічна організація Всеукраїнської дитячої спілки «Екологічна варта».

        Однією з традиційних форм залучення до охорони природи, виховання відповідальності за збереження та примноження її багатств – є шкільні лісництва. В 2000 році  було створене перше в місті учнівське лісництво на базі СЗШ № 25.

За шкільним лісництвом закріплено лісу – 363 га, з них земельних площ під зелені насадження – 120 га. Юні лісівники надають посильну допомогу Радянському лісництву, разом з працівниками лісгосподарства вирощують саджанці сосни звичайної, знайомляться з працею лісівників, вивчають різноманіття флори і фауни. Юннати беруть активну участь у природоохоронних заходах.  Вже традиційно юні лісівники кожного року в грудні проводять акцію «Збережи ялинку» - патрулюють на території шкільного лісництва, ведуть пропагандистську роботу по збереженню лісової красуні – ялинки.

       В травні 2008 року на базі СЗШ № 28, Дитячого екологічного центру та  державного підприємства «Дніпродзержинське лісове господарство»  створено нове учнівське лісництво «Варта лісу». За членами лісництва закріплено 0,5 га лісового розсадника. В весняно-літній період учні доглядають за сіянцями сосни звичайної та клену гостролистого. Є шкілка, де висаджують на дорощування саджанці. Крім цього, гуртківці проводять дослідницьку роботу, вивчають основні лісотворні породи  та лікарські рослини. Робота лісництва була представлена на виставці-експозиції учнівських лісництв Дніпропетровської області у ІІ та ІІІ Всеукраїнських зльотах учнівських лісництв (2008 р. – м. Суми; 2009 р. – м. Рівно). Бурхович Ганна  - дипломант ІІ та ІІІ Всеукраїнських зльотів учнівських лісництв.

      На сьогодні ДЕЦ має високий рівень роботи за пріоритетними напрямками еколого-натуралістичної діяльності в Дніпропетровської області та Україні, постійно веде пошук нетрадиційних форм роботи з учнівською молоддю. Завжди за підтримки управління освіти і науки міської ради вихованці ДЕЦ беруть участь в міжнародних науково-освітніх програмах і проектах :

• «Вчителі та учні досліджують рослини в космосі»;
• «Насіння – ІІ»;
• «Brassica and Butterfly»;
• «Міжнародний інститут води»;
• «Daphnia - індикатори чистоти води»;
• «GLOBE».

     Юннати екоцентру Симонова Ірина, Афендик Гліб, Сирота Дмитро брали участь в міжнародних українсько-американських телемостах по науково-освітніх програмах з космічної біології.

      На сьогодні Дитячий екологічний центр виконує роль координаційно-методичного центру з питань охорони природи, натуралістичної, профорієнтаційної, дослідницької роботи та екологічного виховання дітей. На базі Дитячого екологічного центра постійно проводяться Всеукраїнські, обласні та міські методичні заходи (семінари, науково-практичні конференції тощо).

      Значну увагу педагоги приділяють навчально-виховному процесу, організації змістовного дозвілля вихованців.

     ДЕЦ має великий потенціал, традиції, атмосферу ініціативи і творчості. Серед педагогічного колективу працюють прекрасні керівники гуртків, талановиті педагоги. Ветеранами юннатівського руху є В.П. Казанцева,      А.І. Гаврилюк, Р.О. Придаток, А.В. Толстова, Л.М. Плужник та інші. Колишні юннати центру нині - кандидат хімічних наук Т.П. Толстова, вчителя біології О.С. Рубан, І.В. Симонова, керівники гуртків Ю.В. Ісупова, А.В. Катренко, ветеринарні лікарі Ю.Ю. Юрченко, М.О. Гармаш та інші.

     Дитячий екологічний центр допомагає учням визначати свій життєвий шлях, обрати професію. Багато юннатів продовжують навчання за біологічними та сільськогосподарськими спеціальностями. Всі вони бережуть любов до рідної землі, добру згадку про екоцентр, що навчив їх розуміти природу, допомагати їй.